Okulumuz 2006-2007 eğitim-öğretim yılında 2.dönem açılmış olup 18 derslik ve zemin + 2 katlı bir bina olarak faaliyete girmiştir. Aynı eğitim ve öğretim yılında okulumuz bünyesinde anasınıfı açılmıştır. 2007 yılında da okulumuza kapalı spor salonu yapılmış ve hizmete açılmıştır.2006-2007 yılında faaliyete giren okulumuz, Türkiye Şeker Fabrikaları Genel Müdürlüğü'nün Ankara'da faaliyet gösteren Yardımlaşma Ve Dayanışma Derneği tarafından yapıldığı için ve Erciş Şeker Fabrikası'nın 14.000 m2 arsası tahsis edilerek inşa edildiği için Şeker Fabrikası İlköğretim Okulu ismini almıştır. 2012 yılında ise Şeker Fabrikası Ortaokulu olarak değişmiştir.